Несмотря на многовековую историю породы, в начале 20-го века, когда изменился уклад жизни в Голландии и охотники перестали использовать собак для подманивания дичи, Койкерхондье фактически исчезли.
Баронесса Хандерброек из Аммерстол приложила все усилия чтобы возродить породу. Она дала прядь шерсти и изображение Kooikerhondje посыльному, который смог разыскать пару используемых по назначению собак. Сука Tommie из Фризлэнда стала прародительницей современного Койкерхондье. Первый помет родился в 1942 году и был назван Van Walhalla. И лишь внук внучки Tommie по кличке Carlienke Van Walhalla, был первым Койкерхондье, допущенным к предварительной регистрации.
Первые показы Койкерхондье как породы состоялись на выставках, организованных голландским Кеннелклубом в 1958, 1959 и 1961. Предварительное признание породы состоялось 18 июня 1966 года, а официальное — 20 декабря 1971 года. С этого момента стандарт породы не изменялся.
